Publique su nota aquí (Colaborador@ Registrado)
Este es su espacio para publicar contenido, compartir experiencias, distribuir noticias, hacer comentarios sobre literatura, plantear preguntas, solicitudes de ayuda, sugerencias, apoyo a sus cursos, proyectos en marcha, recursos bibliográficos, etc, cualquier cosa sobre la Morfometría en general!

Todos puen colaborar, una vez que se han registrado. Para registrarse como "colaborador", envíe su email al Editor.

Contenido más reciente:

3 de abril de 2018

Course: Geometric Morphometrics. Berlín. 2018

Asistí al curso de Morfometría Geométrica ofrecido por Physalia Courses, con el Dr. Carmelo Fruciano como instructor.
Se llevó a cabo en el Eurocentres, en la ciudad de Berlín, Alemania del 5 al 9 de marzo y de las 9:30 de la mañana a las 17:30 horas, aunque el interés de los asistentes y el entusiasmo del instructor extendieron el tiempo desde media hora y hasta una hora más del definido; esto no fue una molestia en lo absoluto, al contrario. Asistimos siete personas con diferentes intereses y grupos de trabajo: plantas, peces, mamíferos, tardígrados y moluscos.
El primer día, la sesión versó sobre los fundamentos/historia/conceptos básicos de la morfometría geométrica, pasando por especificaciones sobre el equipo a utilizar para obtener las imágenes, los posibles problemas con los métodos de preservación, la gran variedad de software disponible para este tipo de análisis (con sus "ventajas y desventajas"), y los tipos de diseños de estudio dependiendo de la(s) pregunta(s) a responder.
El día dos, profundizamos en el análisis Procrustes Generalizado y cómo las variables obtenidas a partir de éste son la materia prima de cualquier análisis posterior: componentes principales, componentes principales entre grupos, variables canónicas, diferencias entre medias; así como ejemplos de cuándo ha sido bien aplicado un tipo de análisis y cuándo no, respecto al tipo de pregunta planteada.
Para el tercer día empezamos a pronfundizar aún más, lo cual no quiere decir que los primeros temas hayan sido simples o fáciles. Revisamos los conceptos básicos y los análisis/software adecuados para evaluar el cambio de la forma respecto al tamaño, el cambio de forma de una estructura respecto a otra y, aspectos como la modularidad y la integración.
En el cuarto día nos sumergimos en el análisis de la asociación entre variables de forma y variables ambientales. A lo largo de estos días tuvimos la oportunidad de trabajar con nuestros propios datos y con una base de datos (configuraciones) que reunimos entre todos los asistentes, consistente en peces de agua dulce de diferentes localidades de Europa; con estos datos y otros adicionales proporcionados por el instructor, pudimos hacer los análisis relacionados con la asociación de variables de forma y variables geográficas, estacionales, entre otras.
En el quinto y último día del curso, abordamos el tema de las variables de forma y su relación con la filogenia, desde el enfoque de mapear los datos morfométricos en filogenias reconstruidas a partir de otras fuentes. En este día, los asistentes hicimos una pequeña exposición de nuestro proyecto, habiendo tratado los datos con el software (TPSUtil, TPSDig y TPSRelW, MorphoJ y R)/análisis que vimos en el curso, lo cuál fue una excelente manera de evaluar nuestro aprovechamiento. A lo largo del curso y en modo demostrativo, vimos el funcionamiento de software como Landmark Editor, Passage, Meshlab y RVComparison.
Sin subestimar el contenido del curso, las comidas grupales fueron lo mejor, todos los días todos los asistentes comimos juntos, y fue un gran gusto encontrar que el instructor es una persona sencilla, bromista, abierta, que no sólo habla de ciencia, que puede hablar de cualquier tema (música, comida, futbol, etc) e incluso tener los mismos conflictos existenciales que cualquier asistente al curso. El resto de los compañeros también se integró en esta dinámica que fue muy enriquecedora en el aspecto personal. Dejo algunas fotos de la hora de la clase, la hora de la comida y la clásica foto grupal.






13 de febrero de 2018

Mini Simposio de Morfometría Geométrica

Mini Simposio de Morfometría Geométrica
Presentación de proyectos piloto desarrollados por estudiantes del curso de MG en el INECOL.

Donde?: Auditorio 1, edificio A, Campus III, INECOL. Xalapa.
Hora: 10-12 am
Cuando?: 22 y 23 de febrero.

Invita, Dr. Jorge Chollet Villalpando, Coordinador del Curso


2 de enero de 2018

Curso "Introduction to Geometric Morphometrics", 30 de abril - 5 de mayo

Estimados colegas,

Ya está la abierta la matrícula para la novena edición del curso "INTRODUCTION TO GEOMETRIC MORPHOMETRICS".

Profesores: Prof. Chris Klingenberg (University of Manchester, Reino Unido) y Dr. Jesús Marugán (UAM, España).

Fechas: del 30 de abril al 5 de Mayo.

Más información y matrícula: http://www.transmittingscience.org/courses/geometric-morphometrics/introduction-geometric-morphometrics/

El curso se imparte en inglés (max. 25 plazas).

Programa:
1. Introducción: Forma, tamaño y morfología biológica.
2. Datos morfométricos: landmarks, contornos y superficies.
3. Visualización de formas y cambio morfológico.
4. Evaluando la variación: ACP.
5. Distinguiendo grupos: ACV y análisis discriminante.
6. Simetría y asimetría.
7. Morphometría en un mundo desordenado: valores atípicos y medición del error.
8. Regresión y alometría.
9. Covariación: PLS.
10. Integración morfológica.
11. Modularidad.
12. Filogenia y métodos comparativos.
13. Combinación de análisis para resolver cuestiones biológicas.
14. Presentación de los trabajos de grupo por los participantes.

Para cualquier consulta podéis escribir a courses@transmittingscience.org

3 de noviembre de 2017

Conferencia: "Morfometría Geométrica para la filogenia de especies de Gerreidae (Teleostei: Perciformes)"


El Instituto de Ecología, A.C., se complace en invitar al

SEMINARIO INSTITUCIONAL

"Morfometría Geométrica para la filogenia de especies de Gerreidae (Teleostei: Perciformes)".

Ponente: Dr. Jorge Guillermo Chollet Villalpando,
Investigador Posdoctoral,
Red de Biodiversidad y Sistemática, Laboratorio de Morfometría,

Fecha de presentación: Jueves 9 de noviembre de 2017.
12 horas, Auditorio 1, Campus III.
INECOL, Xalapa

Resumen.
La familia Gerreidae (mojarras), contiene a los géneros Neotropicales: Deckertichthys, Diapterus, Eucinostomus, Eugerres y Gerres. Las especies de mojarras poseen importancia ecológica y económica debido a su persistencia y abundancia en las zonas tropicales y subtropicales del mundo. Estos han sido objeto de estudios sobre su taxonomía y filogenia, sin embargo no han sido abordados de manera integrativa. El objetivo es determinar si la morfología corporal (n= 488), el hueso urohial (n= 451) y el sulcus acusticus del otolito sagittae (n=447) de los cinco géneros (19 especies) de mojarras contiene información que contribuya en la discriminación de las especies, postulando al mismo tiempo una hipótesis filogenética basada en los datos morfométricos, caracteres merísticos codificados y secuencias moleculares parciales de ADN nuclear (RAG1) y mitocondrial (COI, 16SrRNA y 12SrRNA). Se llevó a cabo un análisis de morfometría geométrica (MG) a partir de 24 puntos que describen la forma corporal, 44 para el hueso urohial y 39 para el sulcus acusticus. Todas las comparaciones morfológicas entre las 19 especies de Gerreidae fueron estadísticamente significativas de acuerdo a los Análisis de Variables Canónicas. La filogenia derivada de la matriz combinada se uso para interpretar la contribución de cada tipo de caracter en las relaciones filogenéticas. Los caracteres mas cuestionados han sido los morfométricos. No obstante este estudio revela que las coordenadas contribuyen igual o mejor que los otros tipos de datos, en vista de los valores de congruencia entre caracteres.
La conferencia se transmitirá via BlueJeans gracias al apoyo de Juan Chávez Alarcón, Encargado de Videoconferencias. Tecnologías de Información y Comunicaciones. Instituto de Ecología, A.C. Quien este interesado(a) en conectarse deberá escribirme por email para darles indicaciones. Saludos

Lista de invitados para la transmisión via BlueJeans:

1. Cristian R. Palacios, U. Arizona, Tucson.
2. Maria A. Gutierrez, UA Morelos , Cuernavaca.
3. Romano Abraham Vázquez-García, Facultad de Ciencias,UNAM. CDMX.
4. Anahi Esquivel,  UA Hidalgo, Pachuca.
5. Francisco Javier Garcia, CICIMAR, La Paz, BCS. 
6. Jose de la Cruz Agüero,  CICIMAR, La Paz, BCS. 
7. Eduardo Menoza Almazan, UA Guerrero, Acapulco. 
8. Maria Guadalupe López Garduño, UA Edo. Mexico, Toluca.







29 de septiembre de 2017

Course: Geometric Morphometrics. 2018. Berlin

5-9 March 2018
Introductory and intermediate geometric morphometrics.
Berlin, Germany.

INSTRUCTOR

Queensland University of Technology (Brisbane, Australia)

PROGRAM
5 March 2018

Geometric morphometrics: overview and potential applications:

-       Traditional and geometric morphometrics
-       An overview of common analyses
-       Examples of geometric morphometrics applied to biological problems


>From biological objects to numerical representation:

-       Overview of typical devices used to digitalise biological objects
-       Landmarks, semilandmarks, outlines and surfaces - different types of 
geometric morphometric data
-       Most commonly used geometric morphometric software
-       Data quality, most common pitfalls in study design and data acquisition


6 March 2018

Generalized Procrustes analysis (GPA) – the core of most geometric 
morphometrics:

Principal component analysis (PCA)

Comparing groups:
-       Between-group PCA
-       Canonical variate analysis (CVA)
-       Tests of difference in means



7 March 2018

Co-variation between size and shape:

-       Allometry, regression and general linear models

Co-variation between shapes:

-       Partial least squares analysis (PLS)
-       Modularity and integration

8 March 2018

Combining analyses in a basic workflow:

-       Preliminary assessment of data quality
-       Typical basic workflow

Expanding the basic workflow: variation in geographic space

Expanding the basic workflow: association between shape and environmental 
variables

9 March 2018

Expanding the basic workflow: elements of phylogenetic comparative analyses

Review and open discussion

Presentation of attendees’ analyses on their own data


Please visit our website to get more information about the course: 
https://www.physalia-courses.org/courses-workshops/course22/

Publicar contenido: